본 방법은 수원대 박훤범 교수님방의 안박사님께서
2003년도 쯔음에 알려주신 방법.. ㅋㅋ 철현이형 댕쓰~!! ^^ㅋ
요즘 생명공학을 공부하면서 Blast 툴을 모르는 사람은
아마도 거의 없을 것이다. (분명 몰라도 상관없는 분들 계시리라 믿는다. ^^)
blastn : search a nucleotide DB, using a nucleotide query
blastp : search proein DB, using a proein query
blastx : search protein DB, using a translated nucleotide query
tblastx: search translated nucleotide DB, using a translated nucleotide query
tblastn: search translated nucleotide DB, using a protein query
blastn과 blastp의 경우 이름에 나와있다시피
크게 헷갈릴일이 없다. ^^
query와 db모두 같으니 말이다.
그러나 blastx/tblastn/tblastx의 경우 query와 db가 동일하지 않아서
많은 경우 헷갈리고 결국 구글님께 문의를 하게된다.
blast 앞에 t가 붙는 것은 search translated nucleotide DB
blast 뒤에 x가 붙는 것은 using a translated nucleotide query
로 외워주시면 다른 정보는 유추 가능하므로 헷갈리지 않겠지요.. ^^
사실.. 구글님께 때마다 여쭤보는게 사실 가장 편하고 빠르고 정확하긴 합니다. ㅋㅋ
Posted by gwlee
