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출처: 영문 Wiki, 한글 Wiki
비타민(Vitamin)이란? 생명체가 살아가는 데 중요한 역할을 하는 분자로, 많은 양이 필요하진 않지만 몸에서 아예 만들어지지 않거나 충분하게 만들어지지 않기 때문에 음식으로부터 섭취해야만 하는 분자들.
2010년 2월 어느날 BGI의 한 프로젝트 기사
원래는 기사 다 볼수있었는데... 여튼..
내용은 1,000개의 식물과 동물(설마 각각 1,000종;;; ㅎㄷㄷㄷ) 게놈시퀀싱 프로젝트의 일부분으로 Big Cats Genome Project를 진행한다는...
Big Cats.. 란,바로 Amur tiger, the South China tiger, the Bengal tiger, the Asian lion, the African lion, the cloud leopard, and the snow leopard 이 녀석들을 가리킵니다.
근데, 도입부의 비타민과 Big Cats들이 무슨상관인데??
우리 인간들은 식물과 약제로써 비타민을 보충하는데 육식동물들은 식물을 먹지
않음에도 뜀박질하면서 사냥하고 잘산다.
하긴 그녀석들은 고기를 날로 먹으니 거기에서도 비타민을 섭취가능하지만
그런 것이 활동유지에 필요한 만큼될까? 된다면.... 이연구 접어야지 모;; 제길..
여튼 이 연구 아이디어는 육식동물에게는 우리와 달리 게놈이나
장내 미생물에서 비타민을 합성하는 녀석들이 있지 않을까라는 의문에서
시작했습니다.
(사실 김박사의 기본 아이디어가 아니었으면 모 돈많고 인간수 되니깐 일단
시퀀싱하고 보는구나 라고 했는데... 사실 일단 그게 진실일듯;; ㅋㅋ)
그래서 식물에서 비타민 관련 유전자를 다음의 Keyword로 선별하였습니다.
vitamin = ['retinol','retinal','retinoids','carotenoids','thiamine','riboflavin','niacinamide',
'niacin','pantothenic acid','pyridoxine','pyridoxamine','pyridoxal','Biotin',
'folinic acid','folic acid','cyanocobalamin','hydroxycobalamin',
'methylcobalamin','ascorbic acid','ergocalciferol','cholecalciferol','tocopherols',
'tocotrienols','menaquinones','phylloquinone']
그리고 근래 시퀀싱된 인제 장내 미생물의 meta genome sequence와
단순 blast로 비교해보고 있습니다.
역시 장내 미생물에서 비타민관련 유전자들은 적은것 같습니다.
(이 아이디어가 성립되려면 당연히 인체 장내 미생물들은 비타민과 관련이 없어야겠지요.. ^^)
어차피 중국이 Illumina와 454, SOLiD를 미친듯이 사서 돌리고있지만..
내년이면 나오는건 아니겠지?? ;;;
연구실에 돌아갈쯔음에서는 Big Cats 뿐만아니라 Big Cats의 장내 미생물들도
Genome project 선언하고 결과보여주면 감사할듯 합니다.
Posted by gwlee
